משפחה של אנשים קטנטנים גרה, מתחת לקורות רצפת העץ, באחוזה הממוקמת על גן קסום בטוקיו. ארייטי הזערורית גרה שם עם שני הוריה הקטנטנים מוקפים בחפצים פצפונים. דיירות הבית, שתי נשים זקנות, לא מודעות כלל לקיומם של הדיירים המיניאטורים מתחת לרגליהן. כל חפציהם של ארייטי ומשפחתה "נלקחו בהשאלה" או עשויים מדברים שנלקחו. האוכל והמים, השולחנות והכיסאות, כלי המטבח וגם פינוקים פה ושם – קוביית סוכר שנזנחה מאחור, חתיכת בד עודף. אך רק קצת כל פעם כדי שהגברות הזקנות לא תשמנה לב. יום אחד נכנס להתגורר בבית הזקנות ילד בן 12 בשם שו. בניגוד להזהרות החוזרות ונשנות של הוריה, ארייטי הסקרנית לא מתאפקת מלהתבונן בילד ולהתקרב אליו עד שלבסוף היא מתגלה על ידיו. השניים מוצאים זה בזו אוזן קשבת לסודותיהם וחברות אמת מתחילה לפרוח בין בן האנוש ל"לקחנית" הקטנטנה...
ילדים עד גיל 12 נכנסים בליווי מבוגר.